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导言：2022年是党的“二十大”召开之年，也是实施“十四五”规划关键之年。站在历史的重要时刻，低碳绿色高质量发展对动物营养与饲料学科自主创新吹响了新的集结号。推进动物营养学术交流，助力青年学者成长，是“颐和青年奖活动”恒久的宗旨，近期本活动将陆续呈现2022颐和青年学者们近几年来的科技创新成果。在此，感谢山东龙昌集团对本次活动的大力支持。
胡永飞 教授
农业农村部饲料安全与生物学效价重点实验室推荐青年学者
中国农业大学动物科学技术学院教授
01
个人简介
▪研究方向：肠道微生物、细菌耐药
2010年获中国科学院微生物研究所微生物学博士学位，毕业后留所任助理研究员、副研究员。2018年6月以“杰出人才”引进中国农业大学，任动物科学技术学院教授；中国农业大学青年科学家创新团队负责人。先后主持国家和省部级项目10余项；发表SCI论文60篇，其中以第一或通讯作者在Nature Communications、Microbiome等杂志发表37篇（影响因子9以上6篇），2篇为ESI高被引论文，单篇最高被引552次，h-index 31；发表国内核心期刊论文15篇；申请及授权国内发明专利6项；副主编及参编著作4部，审校译著1部。中国科学院青年创新促进会会员；中国生物工程学会终身会员、微生物组学与技术专业委员会委员。Antibiotics-Basel、Front Microbiol杂志Guest Editor；Front Cell Infect Microbiol杂志Associate Editor；The Innovation杂志编委；《微生物学报》第十二届编委。
02
科技创新成果
1、解析了沙门氏菌、产气荚膜梭菌等重要肠道病原菌的基因组变异和进化特征
对分离自北京地区的341株沙门氏菌进行了基因组学分析，发现北京地区禽、畜食品中最主要的沙门氏菌血清型为肠炎沙门氏菌；沙门氏菌基因组中存在大量的噬菌体序列，对于沙门氏菌的遗传多样性起到重要作用（Front Microbiol，2021）。对分离自1937年至2018年的动物源及人源产气荚膜梭菌菌株进行了基因组学分析；提出微生物基因组的“开放性指数（Openness Index）”，并证明产气荚膜梭菌基因组的高度开放性（Microbial Genomics，2020）。该研究是目前为止国际上最大规模的产气荚膜梭菌比较基因组分析。从产气荚膜梭菌基因组中发现一个新的噬菌体裂解酶基因（申请专利CN202010298999.8），已与企业共建“坏死性肠炎绿色防控技术实验室”对其开发利用。
2、揭示了耐药基因在动物及人体肠道菌群中的生态学分布和转移规律
申请人早期对健康人肠道微生物组中的耐药基因进行了综合分析，首次从宏基因组学层面揭示了人体肠道菌群中耐药基因的多样性及其与兽用抗生素的潜在关联（Nat Commun，2013；Gut Microbes，2014）。随后研究发现多粘菌素耐药基因mcr-1在健康人体肠道细菌中存在，提示其食物链传播途径（Lancet Infect Dis，2016，通信论文）；证实MCR-1蛋白的跨膜区和底物结合位点是其介导多粘菌素耐药所必须的区域（PLoS Pathog，2016）。进一步研究揭示耐药基因在细菌个体间、在动物和人体肠道细菌群体间的转移由细菌种属进化关系所主导，同时受制于生态屏障（Appl Environ Microbiol，2016，Spotlight文章）。整合宏基因组学和宏转录组学手段证实鸡、猪和人体肠道微生物中50%以上耐药基因具有转录活性（Environ Int，2020）。发现活禽市场中的禽类及工作人员肠道菌群中含有更多的耐药基因，提示活禽市场可能是耐药基因或耐药细菌传播的重要界面（Environ Int，2021）。在10个种类迁徙鸟的肠道微生物组中发现了大量可转移的耐药基因，提示野鸟迁徙可能是耐药基因全球传播的重要途径之一（Microbiome，2020）。这些研究为深入认识细菌耐药性的进化、细菌耐药基因在动物和人体之间的传播机制等奠定了重要理论基础。
3、建立了国际上最大的鸡肠道微生物参考基因组和基因集
通过整合来自10个国家的799份鸡肠道微生物宏基因组样本，研究组装了12339个株水平鸡肠道微生物基因组，并构建了一个含有1660万个非冗余基因的基因集。所组装的基因组中有893个种和38个属为可能的新种和新属。耐药组分析结果显示，地域对肠道微生物耐药基因的影响小于宿主差别。研究获得的数据集以独立项目存储于国家微生物科学数据中心 （https://nmdc.cn/icrggc/） （Commun Biol，2021）。在此基础上，开展了鸡肠道微生物培养组学研究，获得细菌纯培养物近4000株，并从中鉴定了具有缓解蛋鸡脂肪肝作用的巨单胞菌（申请专利202110953213.6）。
4、揭示了肠道短链脂肪酸产生菌在机体感染性和代谢性疾病中的作用和机制
发现结核菌感染患者肠道菌群中大量缺失短链脂肪酸产生细菌，三个菌株的丰度组合对于病原菌是否感染具有良好的预测作用（Front Cell Infect Microbiol，2019）。揭示菊粉促进了小鼠肠道短链脂肪酸产生菌Prevotellaceae UCG 001的增殖，从而调控AMPK信号通路改善宿主脂代谢紊乱（Genomics Proteomics Bioinformatics，2019）。
03
科技创新情况
青年学者推荐汇总
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